Речь идёт о любых соответствиях расширений приложениям. В данном конкретном случае рассматривается некорректное открытие ссылок внутри PDF-файлов, просматриваемых с помощью Okular, через текстовый редактор gedit. Все операции производятся в Ubuntu 16.04.3 LTS.
- Выполнить команду
kcmshell4 filetypes - Найти в списке типов желаемый html и поднять на первое место необходимое приложение в поле Application Preference Order
- Нажать Apply и OK. Перезапустить при необходимости Okular